一、主管机构不同
报关是指货物运输前，海关递交资料，进行申报的手续，海关放行后，货物才可以装运。针对海关部门。

报检是指货物运输前，向检验检疫局报请检验货品，一般都是先报检后报关。针对检验检疫部门。

二、产生的次序存在先后
一般情况下，报检是先于报关的，先完成报检，在商检部门检验完毕确认无误之后，海关才会接受报关申请，之后才是一系列的审单、征税、放行等环节。但是实际在货物的进出口的过程中，不是所有的货物都需要经过报检，只有一些国家明确规定需要报检的货物才必须进行报检，但所有进出口的货物都必须报关。

三、各司其职，互不影响
报关和报检都是办理进出口货物运输的环节之一。两者之间互不影响，不会因为没有操作哪个环节而影响另外一个。但实际货物进出口时，如果是明确规定需要报检的，一般都会同时完成申请，以免出现偏差。

四、涉及的对象不同
报检涉及的对象指出口前产品的生产、经营部门或进口商品的收货、用货或代理和运输部门按照《进出口商品检验法实施条例》的规定，向商检机构申请办理检验、鉴定手续。
报关涉及的对象可分为进出境的运输工具和货物、物品两大类。由于性质不同，其报关程序各异。运输工具如船舶、飞机等通常应由船长、机长签署到达、离境报关单，交验载货清单、空运、海运单等单证向海关申报，作为海关对装卸货物实施监管的依据。